Co do samego przeprowadzenia takiego zabiegu, trzeba napisać, że nie jest on tak do końca łatwy i bezinwazyjny. Każda osoba z osobna powinna zostać oceniona i przebadana przez lekarza specjalistę, który podejmie decyzję co do podjęcia się takiego zabiegu. Nie jest tak prosto, patrząc na kogoś, powiedzieć czy dana osoba może poddać się takiemu zabiegowi, prościej będzie określić, kto nie powinien poddawać się jemu. Przede wszystkim pacjenci w wieku do 25 lat nie są mile widzianymi kandydatami do przeszczepu włosów. Łysienie w tym okresie życia dopiero się rozpoczyna i będzie nadal postępować, nie do końca wiadomo w jaki sposób. Decyzja o przeszczepie w tym wieku może prowadzić do nierównomiernego tracenia włosów w przyszłości, dlatego nie zaleca się stosowania w tym przypadku zabiegu przeszczepu włosów.

Ograniczenia istnieją także ze względu na płeć. Łysienie w przypadku męskiej części populacji wygląda inaczej niż łysienie wśród kobiet. Zazwyczaj łysienie u mężczyzn rozpoczyna się od czoła głowy lub też od jego czubka, jednak jego skutek zazwyczaj jest jednakowy – łysa głowa z wyjątkiem pasma włosów na jej tyle. Kobiety natomiast zaczynają proces łysienia inaczej. U pań tego typu utrata włosów rozpoczyna się w miejscach, gdzie znajduje się naturalny przedziałek, czyli na środku głowy. Dlatego lepiej przeszczep włosów wykonuje się mężczyznom, kobietom raczej nie poleca się tego typu zabiegów. Mówiąc wprost - nie wykonuje się jego tej płci. Każde zabiegi przeprowadzane są przez lekarzy specjalistów, którzy z początku oceniają, gdzie należy umieścić przeszczepy włosów, żeby osiągnięty efekt był zadowalający i dla klienta i dla lekarza.